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R可視化——曼哈頓圖

2022-07-28 08:49 作者:科研那點(diǎn)事兒  | 我要投稿

曼哈頓圖(Manhattan plot)是一種GWAS分析中常用的展示基因組數(shù)據(jù)的散點(diǎn)圖。今天,小編就帶大家看一下如何使用R語言中的qqman、CMplot及ggplot2三個(gè)包繪制曼哈頓圖。

基于qqman包繪制

1、安裝、加載R包

2、數(shù)據(jù)

圖片


3、繪圖

圖片


基于CMplot包繪制

1、安裝、加載包

2、數(shù)據(jù)

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3、繪圖?

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基于ggplot2包進(jìn)行繪制

1、安裝、加載包

2、數(shù)據(jù)及其處理

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3、繪圖

圖片

參考:

1)https://blog.csdn.net/ddxygq/article/details/103555955

2)https://mp.weixin.qq.com/s/IO5rqz8sXaYD5vc5EbkkPw

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