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【文獻(xiàn)速遞】【Nature methods】【2022年】【1月】

2022-08-12 15:32 作者:Rt_Cola  | 我要投稿

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FlyWire:全腦連接組學(xué)在線(xiàn)社區(qū)

2. Cross-modal coherent registration of whole mouse brains

整個(gè)小鼠大腦的跨模態(tài)連貫配準(zhǔn)

3. Fast optical recording of neuronal activity by three-dimensional custom-access serial holography

通過(guò)三維定制訪(fǎng)問(wèn)串行全息術(shù)快速光學(xué)記錄神經(jīng)元活動(dòng)

4. Lineage recording in human cerebral organoids

人腦類(lèi)器官中的譜系記錄

5. Rapid, efficient and activation-neutral gene editing of polyclonal primary human resting CD4+ T cells allows complex functional analyses

多克隆原代人類(lèi)靜息CD4+ T細(xì)胞的快速、高效和激活中性基因編輯允許進(jìn)行復(fù)雜的功能分析

6. Monitoring protein conformational changes using fluorescent nanoantennas

使用熒光納米天線(xiàn)監(jiān)測(cè)蛋白質(zhì)構(gòu)象變化


基于DNA或者PEG的熒光天線(xiàn),一端含有熒光基團(tuán)(比如FAM),另一端含有生物素來(lái)促進(jìn)接觸(開(kāi)始)。我們使用生物素連接納米天線(xiàn)到含有四個(gè)生物素位點(diǎn)的野生型鏈霉親和素,可以觀(guān)察到FAM熒光信號(hào)的下降(或者淬滅)。通過(guò)和生物素化的小牛腸堿性磷酸酶結(jié)合,可以觀(guān)察到明顯的熒光信號(hào)(第二步),證明FAM從鏈霉親和素上釋放。在加入堿性磷酸酶底物后,納米天線(xiàn)產(chǎn)生了一個(gè)暫時(shí)的熒光“尖峰”(第三步),可以用來(lái)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)酶的瞬間底物結(jié)合狀態(tài)。

7. Engineered HaloTag variants for fluorescence lifetime multiplexing

用于熒光壽命多路復(fù)用的工程HaloTag變體

8. Systematic molecular evolution enables robust biomolecule discovery

系統(tǒng)的分子進(jìn)化使強(qiáng)大的生物分子發(fā)現(xiàn)成為可能

9. Fast and flexible analysis of linked microbiome data with mako

使用 mako 快速靈活地分析關(guān)聯(lián)的微生物組數(shù)據(jù)

10. Benchmarking atlas-level data integration in single-cell genomics

在單細(xì)胞基因組學(xué)中對(duì)圖譜級(jí)數(shù)據(jù)集成進(jìn)行基準(zhǔn)測(cè)試

11. Method of the Year: protein structure prediction

年度方法:蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)是我們的 2021 年度方法,用于最近開(kāi)發(fā)的基于深度學(xué)習(xí)的方法,該方法以前所未有的準(zhǔn)確度預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)。在封面上,來(lái)自AlphaFold蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)(https://alphafold.ebi.ac.uk/)的大量蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模型由AlphaFold2方法預(yù)測(cè)。


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