Nature文獻(xiàn)解讀 | 揭開(kāi)單細(xì)胞CUT&Tag（scCUT&Tag）的神秘面紗！
2021年4月12日，美國(guó)華盛頓大學(xué)Anoop P. Patel和美國(guó)弗雷德·哈欽森癌癥研究中心Steven Henikoff研究團(tuán)隊(duì)在《Nature Biotechnology》上發(fā)表一篇“Single-cell CUT&Tag analysis of chromatin modifications in differentiation and tumor progression”的文章[1]。
結(jié)果顯示H3K27me3的scCUT＆Tag分析可區(qū)分人血中的細(xì)胞類型，并允許從異質(zhì)組織生成特定細(xì)胞類型的多梳基團(tuán)（PcG）景觀。
此外，他們使用scCUT＆Tag對(duì)治療前后腦腫瘤患者的H3K27me3進(jìn)行了分析，鑒定了腫瘤微環(huán)境中的細(xì)胞類型以及主要樣品和治療后PcG活性的異質(zhì)性。
作者（Henikoff）和方法（ scCUT&Tag），大家會(huì)不會(huì)有點(diǎn)似曾相識(shí)？就是我們之前的中提到的Henikoff和CUT&Tag技術(shù)。
Henikoff團(tuán)隊(duì)在本文中，針對(duì)bulk CUT&tag技術(shù)，巧妙“嫁接”10x單細(xì)胞捕獲平臺(tái)，將每個(gè)細(xì)胞標(biāo)記上特定的barcode，實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞分辨率的蛋白-DNA互作關(guān)系研究。
研究策略樣品：小鼠中樞神經(jīng)系統(tǒng)的成千上萬(wàn)個(gè)細(xì)胞，PBMC細(xì)胞；
檢測(cè)靶標(biāo)：活躍啟動(dòng)子、增強(qiáng)子和基因體（H3K4me3、H3K27ac和H3K36me3）；非活性區(qū)（H3K27me3）；
檢測(cè)平臺(tái)：CUT&Tag ，10xGenomics system;
scCUT&Tag（10.1038/s41587-021-00865-z）
方案1：神經(jīng)細(xì)胞（先提細(xì)胞核）
方案2：PBMC細(xì)胞（Tn5片段化后再抽核）
愛(ài)博泰克作為酶原料商，成功克隆了pA-Tn5，pG-Tn5，及pAG-Tn5轉(zhuǎn)座酶，可以提供無(wú)縫替換的核心酶元件。
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