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熱圖（Heatmap）一直是生信分析數(shù)據(jù)結(jié)果展示的好幫手，能很好的將結(jié)果清晰呈現(xiàn)，在組學(xué)研究的相關(guān)文章中，熱圖作為一種對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)及其分析結(jié)果的直觀的表達(dá)方式，在很多文章中都有著不可或缺的地位。它是一種將規(guī)則化矩陣數(shù)據(jù)信息轉(zhuǎn)換成顏色色調(diào)的常用的可視化方法，其中每個(gè)單元對(duì)應(yīng)數(shù)據(jù)的某些屬性，屬性的值通過(guò)顏色映射轉(zhuǎn)換為不同色調(diào)并填充規(guī)則單元。

熱圖是非常常見(jiàn)的圖形，在R語(yǔ)言中有非常多的R包可以畫(huà)熱圖，比如pheatmap等，但complexheatmap包無(wú)疑是其中的老大哥，其功能之全面遠(yuǎn)超其他同類(lèi)R包。ComplexHeatmap 不僅可以畫(huà)單個(gè)的熱圖，也可以制作多個(gè)熱圖及注釋信息相互組合起來(lái)的更為復(fù)雜的圖形。復(fù)雜熱圖可用于展示同一個(gè)數(shù)據(jù)集或不同數(shù)據(jù)集之間的關(guān)系或揭示內(nèi)部規(guī)律。ComplexHeatmap包可提供靈活的熱圖展示及高度自定義的注釋圖形。

高分期刊文獻(xiàn)往往不僅創(chuàng)新性好，工作量大，其中的配圖同樣美觀且能很好地反映數(shù)據(jù)內(nèi)容。下面我們來(lái)看下在熱圖的基礎(chǔ)上怎么增加柱狀圖來(lái)將圖形變得更高級(jí)。代碼相關(guān)文件見(jiàn)如下3個(gè)文件夾，文末可知如何領(lǐng)取。

1.????? 加載相應(yīng)R依賴(lài)包：

library("ComplexHeatmap")

2.????? 數(shù)據(jù)導(dǎo)入

輸入數(shù)據(jù)格式如下所示，我們用一個(gè)簡(jiǎn)單的矩陣作為例子。

3.????? 基本熱圖繪制

?????? 先來(lái)看下這個(gè)數(shù)據(jù)的熱圖結(jié)果。

?????? 然后我們把在右邊的標(biāo)簽換到左邊,使用參數(shù)row_names_side = "left"。

4.????? 添加柱狀圖

接下來(lái)就是添加柱狀圖,也是本文最關(guān)鍵的一步，對(duì)熱圖每個(gè)基因的數(shù)據(jù)之和進(jìn)行統(tǒng)計(jì)并在熱圖正上方繪制柱狀圖，對(duì)每行數(shù)據(jù)之和進(jìn)行統(tǒng)計(jì)并在熱圖右側(cè)繪制柱狀圖。

到這里圖形就完成了，效果如下圖所示，大家可以嘗試用我們的示例數(shù)據(jù)跑起來(lái)，也可以用自己的數(shù)據(jù)進(jìn)行嘗試。

如需代碼及示例數(shù)據(jù)等文件，請(qǐng)掃碼聊天框回復(fù) “B31”領(lǐng)取！?

寫(xiě)在文末：

如果您近期想做生信方面的文章而苦于沒(méi)有思路，或者不知道如何來(lái)入手生信分析，或者兌具體的某一個(gè)圖有作圖需求，都可以?huà)叽a咨詢(xún)小云，我們有專(zhuān)業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì)，生信熱點(diǎn)思路設(shè)計(jì)、生信分析、熱點(diǎn)方向生信挖掘等，如有需要，可掃碼下方二維碼了解詳情：

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