分子蒸餾也叫做短程蒸餾，其為一項比較新的還沒有在工業(yè)化生產(chǎn)中得到廣泛應用的液-液分離技術，其應用可以將大量常規(guī)蒸餾技術所無法解決的問題解決掉。分子蒸餾為一種在高真空下操作的蒸餾方法，此時這時蒸氣分子的平均自由程要比蒸發(fā)表面與冷凝表面之間的距離大，從而能夠?qū)α弦褐懈鹘M分蒸發(fā)速率的不同加以利用，來分離液體混合物。分子蒸發(fā)器、脫氣系統(tǒng)、進料系統(tǒng)、加熱系統(tǒng)、冷卻真空系統(tǒng)和控制系統(tǒng)為一套完整的分子蒸餾儀的主要構(gòu)成組分。分子蒸發(fā)器為分子蒸餾裝置的核心部分。

　　短程蒸餾儀對于進行分子蒸餾相當?shù)暮线m，分子流從加熱面直接到冷凝器表面。分子蒸餾有如下四個過程：
　　一、分子從液相主體往蒸發(fā)表面擴散
　　一般，液相中的擴散速度為對分子蒸餾速度進行控制的主要因素，因此應當盡可能對液層厚度進行減薄以及對液層的流動進行強化。
　　二、分子在液層表面上的自由蒸發(fā)
　　隨著溫度的升高，蒸發(fā)速度不斷上升，然而隨著溫度的升高，分離因素有時會降低，因此必須以被加工物質(zhì)的熱穩(wěn)定性作為前提，對經(jīng)濟合理的蒸餾溫度進行選擇。
　　三、分子從蒸發(fā)表面向冷凝面飛射
　　蒸氣分子由蒸發(fā)面往冷凝面飛射的過程中，可能會彼此相互碰撞，也與在兩面之間殘存的空氣分子發(fā)生碰撞的可能性。因為蒸發(fā)分子要遠遠比空氣分子重，并且大部分運動方向相一致，因此，它們自身碰撞不會對飛射方向和蒸發(fā)速度產(chǎn)生較大的影響。然而殘氣分子雜亂無章的熱運動狀態(tài)在兩面間呈現(xiàn)，所以對飛射方向和蒸發(fā)速度產(chǎn)生影響的主要因素為殘氣分子數(shù)目的多少。
　　四、分子在冷凝面上冷凝
　　僅需使冷熱兩面間的溫度差充足（通常在70-100攝氏度范圍內(nèi)），冷凝表面的形式合理并且光滑，那么就被認為能夠瞬間完成冷凝步，因此至關重要的是對合理冷凝器的形式的選擇。