記錄原因：trim_galore 對raw reads進(jìn)行l(wèi)ow quality reads or base 進(jìn)行trim的時候是單線程運(yùn)行的，速度較慢，有一些浪費(fèi)時間，所以為了讓其多線程運(yùn)行，查閱的相關(guān)資料后，總結(jié)了一下多線程運(yùn)行trim_galore的方法，以節(jié)約時間。本記錄為了幫助自己記憶，如有錯誤歡迎指正。

軟件需求：

trim_galore; parallel

多線程質(zhì)控：

1，針對圖1創(chuàng)建命令文件：

2，第一步完成后就會生成一個名為parallel.txt 的文件，然后我們進(jìn)行多線程運(yùn)行：

這樣我們就可以多線程進(jìn)行raw reads的低質(zhì)量剪切，如圖 3，多個trim_galore正在運(yùn)行。

參考：

https://www.gnu.org/software/parallel/parallel.html#example-working-as-cat-sh-resource-inexpensive-jobs-and-evaluation