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孟德爾隨機(jī)化研究-SCI新寵兒

2023-03-02 22:02 作者:小方塊XXL  | 我要投稿

哎呀呀不關(guān)注白嫖好像不太好

等我看完再一鍵三連

孟德爾隨機(jī)化

  • 因果推斷
  • 以遺傳變異為工具變量
  • 推導(dǎo)暴露和結(jié)局的因果關(guān)系
  • 避免傳統(tǒng)流行病學(xué)研究的混雜偏倚
  • 遺傳變異:GWAS;SNP及等位基因、MAF值、eaf值;單倍型;連鎖不平衡

SNP

  • 單核苷酸多態(tài)性

GWAS

  • 全基因組關(guān)聯(lián)研究人類疾病相關(guān)的遺傳變異
  • 主要關(guān)心與特定形狀相關(guān)的snp火基因
  • 數(shù)據(jù)獲?。篽ttps://gwas.mrcieu.ac.uk/

主要和次要等位基因

  • 指頻率位次,即通俗的野生型突變型

MAF值

  • 次要等位基因頻率(以普遍理性而論小于0.5)
  • 用PLINK(某開源軟件)計(jì)算

REF與ALT

  • reference alternative
  • 與頻率無關(guān),決定因素是參考基因組中該位點(diǎn)的基因(個(gè)人理解,比如選了突變型a,那突變型a中的該基因就是REF,其他可能出現(xiàn)的野生型和突變型bcd均為ALT)

效應(yīng)等位基因/其他等位基因

  • 對(duì)表型有貢獻(xiàn)的
  • 一般是minor
  • eaf:effect allele frequency
  • MAF eaf在計(jì)算r方(因?yàn)樵撐稽c(diǎn)突變作為危險(xiǎn)因素)時(shí)可等價(jià)

孟德爾隨機(jī)化研究-SCI新寵兒的評(píng)論 (共 條)

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