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科研代碼分享|R可視化代碼分享:基因與功能之間的關系--GO功能富集網(wǎng)絡圖繪制

2022-06-16 16:41 作者:爾云間  | 我要投稿

科研有捷徑,輸入代碼,一鍵獲取科研成果!就是這么省事,來具體看下有多方便!

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真香提示:文末可以知道如何獲取代碼~? ?

該圖與一般功能富集柱狀圖和氣泡圖相比較的話,其優(yōu)勢在于可以清晰的展示出基因與功能的關系,哪些基因作用于什么功能。輸入數(shù)據(jù)即為2列,一列是基因symbol,一列是差異倍數(shù)log2FC,通過本文中代碼的學習,可以復現(xiàn)該圖做法,得到以下圖表結(jié)果:

1.????? R包安裝及下載

2.????? 示例輸入數(shù)據(jù)

3.????? SymbolentrezID轉(zhuǎn)換

4.????? GO功能富集分析

5.????? 可視化基因-功能網(wǎng)絡圖

如果你不喜歡環(huán)形風格,則可以利用同一個函數(shù)修改不同參數(shù)即可得到以下風格網(wǎng)絡圖,根據(jù)自己審美開始嘗試吧。

如需代碼及示例數(shù)據(jù)等文件,請掃碼聊天框回復 “B18”領??!??


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