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非模式物種做GO富集分析

2023-04-24 09:58 作者:小云愛生信  | 我要投稿

爾云間? 一個專門做科研的團(tuán)隊

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各位小伙伴大家好,小果和大家又見面了,今天我們通過做一下非模式物種的GO富集分析,以玉米的數(shù)據(jù)為實例數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,代碼如下:

01下載需要的R包

02導(dǎo)入需要的包

03導(dǎo)入數(shù)據(jù)

gsym.fc <- read.csv("easy_input_Zm.csv")

04代碼展示

注:最終完成非模式物種玉米的富集分析,并進(jìn)行了繪圖,由于玉米是非模式物種,參考基因組選擇問題,最終能夠富集到的基因很少。這是要注意的問題。

好了,以上就是小果的分享,是不是干貨滿滿呢,小伙伴快去試試吧。


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