无码av一区二区三区无码,在线观看老湿视频福利,日韩经典三级片,成 人色 网 站 欧美大片在线观看

歡迎光臨散文網(wǎng) 會(huì)員登陸 & 注冊(cè)

教你使用R代碼玩轉(zhuǎn)LASSO分析

2023-04-23 09:33 作者:小云愛生信  | 我要投稿

爾云間? 一個(gè)專門做科研的團(tuán)隊(duì)

原創(chuàng)?小果?生信果? 關(guān)注我們


各位小伙伴大家好,小果和大家又見面了,最近呢小果get到一項(xiàng)新技能,可謂是干貨滿滿,今天小果來(lái)教小伙伴們使用R代碼進(jìn)行LASSO分析。分享內(nèi)容從LASSO簡(jiǎn)介,LASSO結(jié)果展示和LASSO分析代碼三塊展開。


#01??LASSO簡(jiǎn)介

LASSO全稱為L(zhǎng)east Absolute Shrinkage and Selection Operator,中文翻譯過(guò)來(lái)是最小絕對(duì)收縮和選擇算子,該算法一種采用了L1正則化(L1-regularization)的線性回歸方法,?這種方法使得部分學(xué)習(xí)到的特征值為0,從而達(dá)到稀疏化和特征選擇的目的。如果小伙伴們實(shí)在理解不了,可以將它理解為一種進(jìn)行變量篩選的算法,然后對(duì)篩選出的變量進(jìn)行cox回歸分析,這個(gè)就是LASSO COX分析。

#02???LASSO結(jié)果展示

說(shuō)了半天的LASSO-COX分析,它的結(jié)果到底是怎么樣,其實(shí)LASSO-COX分析產(chǎn)生兩個(gè)圖,一是LASSO系數(shù)譜(如圖1),二是LASSO交叉驗(yàn)證曲線圖(如圖2)

圖1:



圖2:

#03? ?LASSO-COX分析代碼

LASSO分析需要的文件有兩個(gè),分別是表達(dá)數(shù)據(jù)和生存數(shù)據(jù),小伙伴們可根據(jù)自己的數(shù)據(jù)進(jìn)行整理,其中表達(dá)數(shù)據(jù)是這樣的:


生存數(shù)據(jù)是這樣的:


有了以上的數(shù)據(jù)之后就可以用R代碼進(jìn)行分析了,代碼如下:???


好了,以上就是小云的分享,是不是干貨滿滿呢,小伙伴快去試試吧。


推薦閱讀


關(guān)注小果,小果將會(huì)持續(xù)為你帶來(lái)更多生信干貨哦。

“生信果”,生信入門、R語(yǔ)言、生信圖解讀與繪制、軟件操作、代碼復(fù)現(xiàn)、生信硬核知識(shí)技能、服務(wù)器、生物信息學(xué)的教程,以及基于R的分析和可視化等原創(chuàng)內(nèi)容,一起見證小白和大佬的成長(zhǎng)。?

教你使用R代碼玩轉(zhuǎn)LASSO分析的評(píng)論 (共 條)

分享到微博請(qǐng)遵守國(guó)家法律
离岛区| 景宁| 抚顺市| 泗阳县| 年辖:市辖区| 兰溪市| 连云港市| 玉门市| 白河县| 富平县| 曲周县| 克山县| 霍邱县| 东丽区| 仲巴县| 饶平县| 含山县| 大化| 雷波县| 马尔康县| 莫力| 宁夏| 紫云| 亚东县| 志丹县| 福泉市| 理塘县| 霍州市| 房产| 松潘县| 竹北市| 隆子县| 贵港市| 公主岭市| 湟源县| 云安县| 晋中市| 车致| 文登市| 新晃| 张北县|